MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Escherichia coli O157:H7 str. Sakai plasmid pOSAK1

Total Repeats: 83

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_002127	TTC	2	6	1	6	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_002127	CA	3	6	27	32	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
3	NC_002127	TGG	2	6	33	38	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4	NC_002127	AGC	2	6	74	79	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5	NC_002127	TGC	3	9	125	133	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6	NC_002127	TCTG	2	8	159	166	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
7	NC_002127	CGT	2	6	174	179	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8	NC_002127	CAC	2	6	194	199	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
9	NC_002127	CCG	2	6	215	220	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
10	NC_002127	TCAG	2	8	241	248	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
11	NC_002127	ACA	2	6	249	254	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12	NC_002127	A	6	6	266	271	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_002127	CAG	2	6	272	277	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14	NC_002127	TTG	2	6	282	287	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15	NC_002127	GACAG	2	10	304	313	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
16	NC_002127	AGA	3	9	478	486	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	10955263
17	NC_002127	GCT	2	6	506	511	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	10955263
18	NC_002127	T	6	6	535	540	0 %	100 %	0 %	0 %	10955263
19	NC_002127	GGC	2	6	544	549	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	10955263
20	NC_002127	ACTG	2	8	574	581	25 %	25 %	25 %	25 %	10955263
21	NC_002127	AAG	2	6	597	602	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	10955263
22	NC_002127	A	6	6	626	631	100 %	0 %	0 %	0 %	10955263
23	NC_002127	AG	3	6	662	667	50 %	0 %	50 %	0 %	10955263
24	NC_002127	GA	3	6	744	749	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
25	NC_002127	TCT	2	6	956	961	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
26	NC_002127	ATATT	2	10	968	977	40 %	60 %	0 %	0 %	10955264
27	NC_002127	T	6	6	986	991	0 %	100 %	0 %	0 %	10955264
28	NC_002127	ATG	2	6	1000	1005	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	10955264
29	NC_002127	T	8	8	1044	1051	0 %	100 %	0 %	0 %	10955264
30	NC_002127	TCA	2	6	1089	1094	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	10955264
31	NC_002127	T	7	7	1166	1172	0 %	100 %	0 %	0 %	10955264
32	NC_002127	ATT	2	6	1185	1190	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	10955264
33	NC_002127	A	8	8	1196	1203	100 %	0 %	0 %	0 %	10955264
34	NC_002127	CTTTT	2	10	1215	1224	0 %	80 %	0 %	20 %	10955264
35	NC_002127	AATA	2	8	1289	1296	75 %	25 %	0 %	0 %	10955264
36	NC_002127	T	6	6	1311	1316	0 %	100 %	0 %	0 %	10955264
37	NC_002127	T	6	6	1334	1339	0 %	100 %	0 %	0 %	10955264
38	NC_002127	T	6	6	1343	1348	0 %	100 %	0 %	0 %	10955264
39	NC_002127	CCA	2	6	1370	1375	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	10955265
40	NC_002127	GAT	2	6	1399	1404	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	10955265
41	NC_002127	GATT	2	8	1408	1415	25 %	50 %	25 %	0 %	10955265
42	NC_002127	AAAC	2	8	1462	1469	75 %	0 %	0 %	25 %	10955265
43	NC_002127	CA	3	6	1503	1508	50 %	0 %	0 %	50 %	10955265
44	NC_002127	TA	3	6	1558	1563	50 %	50 %	0 %	0 %	10955265
45	NC_002127	GTTT	2	8	1569	1576	0 %	75 %	25 %	0 %	10955265
46	NC_002127	TGA	3	9	1603	1611	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	10955265
47	NC_002127	CAT	2	6	1623	1628	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	10955265
48	NC_002127	AT	3	6	1639	1644	50 %	50 %	0 %	0 %	10955265
49	NC_002127	T	7	7	1710	1716	0 %	100 %	0 %	0 %	10955265
50	NC_002127	ATT	2	6	1718	1723	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	10955265
51	NC_002127	T	6	6	1741	1746	0 %	100 %	0 %	0 %	10955265
52	NC_002127	T	7	7	1813	1819	0 %	100 %	0 %	0 %	10955265
53	NC_002127	T	7	7	1841	1847	0 %	100 %	0 %	0 %	10955265
54	NC_002127	TGG	2	6	1980	1985	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	10955265
55	NC_002127	ATA	2	6	1988	1993	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	10955265
56	NC_002127	TTA	3	9	2018	2026	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	10955265
57	NC_002127	TCT	2	6	2027	2032	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	10955265
58	NC_002127	AGAA	2	8	2053	2060	75 %	0 %	25 %	0 %	10955265
59	NC_002127	TCA	3	9	2081	2089	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	10955265
60	NC_002127	TCA	2	6	2165	2170	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	10955265
61	NC_002127	AAGT	2	8	2171	2178	50 %	25 %	25 %	0 %	10955265
62	NC_002127	AAG	2	6	2240	2245	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	10955265
63	NC_002127	T	6	6	2288	2293	0 %	100 %	0 %	0 %	10955265
64	NC_002127	GTT	2	6	2400	2405	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
65	NC_002127	T	8	8	2404	2411	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_002127	T	7	7	2430	2436	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_002127	GATT	2	8	2472	2479	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
68	NC_002127	CAT	2	6	2480	2485	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
69	NC_002127	ATAA	2	8	2489	2496	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_002127	ACC	2	6	2503	2508	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
71	NC_002127	GGT	2	6	2518	2523	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
72	NC_002127	GGA	2	6	2575	2580	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
73	NC_002127	CTC	2	6	2643	2648	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
74	NC_002127	GCT	2	6	2666	2671	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
75	NC_002127	G	6	6	2752	2757	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
76	NC_002127	CA	3	6	2764	2769	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
77	NC_002127	G	6	6	2917	2922	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
78	NC_002127	G	6	6	2999	3004	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
79	NC_002127	CTT	2	6	3037	3042	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
80	NC_002127	TGCTT	2	10	3047	3056	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
81	NC_002127	TGAG	2	8	3119	3126	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
82	NC_002127	CGC	2	6	3138	3143	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
83	NC_002127	TGT	2	6	3222	3227	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.